Но эта защита не универсальна, из-за различных инфекционных заболеваний кишечника защитный барьер может разрушиться.
В ротовой полости, глотке и пищеводе происходит предварительная обработка пищи: она измельчается и смешивается со слюной. Механическое измельчение пищи значительно облегчает последующий процесс пищеварения, а затем и всасывания веществ в кровь. Все зубы человека участвуют в процессе измельчения пищи. Отсутствие какого-либо из них затрудняет нормальный процесс пищеварения. Пищу, особенно твердую, необходимо тщательно пережевывать, это необходимо для максимального усвоения из пищи всех питательных веществ.
Слюна способствует безболезненному процессу проглатывания пищи, без нее это было бы весьма затруднительно сделать. Благодаря пережевыванию пищи и обработке ее слюной человек чувствует вкус еды. Именно это и способствует дальнейшему выделению слюны, а через некоторое время и желудочного сока.

Человек вырабатывает около 1 л слюны в сутки.
Состояние зубов также зависит от выработки слюны. Если она вырабатывается в недостаточном количестве, зубы могут начать выпадать или будут поражены кариесом. Кроме всего вышеперечисленного, слюна обладает бактерицидным действием.
Проглатывание пищи происходит в результате произвольного сокращения мышц ротовой полости и непроизвольного – глотки. На начальном этапе проглатывания пищи возникает рефлекс, под действием которого на некоторое время прерывается дыхание.
Из глотки пища попадает в пищевод, представляющий собой мышечную трубку длиной 25—35 см. В начале и в конце пищевода имеются сфинктеры. Благодаря им вместе с пищей в пищевод не проходит воздух, а пища, попав в желудок, не забрасывается обратно в пищевод. Если по каким-либо причинам пищевод или сфинктеры перестают нормально функционировать, возникают неприятные симптомы: тошнота, рвота и т. д.
Вырабатываемый желудком желудочный сок обволакивает попавшую в него пищу. В желудке происходит вторичное механическое измельчение пищи (твердые частички пищи в результате сокращений мышц желудка трутся друг о друга).